两者的区别可以从发病原因、发病表现、发病季节、治疗等方面进行区分。病毒性肠炎中,轮状病毒是婴幼儿腹泻的主要病因,而诺瓦克病毒是成人和大龄儿童流行性病毒性胃肠炎的主要病因。细菌性肠炎多是进食了发霉或有致病菌的不洁食物所引起。病毒性肠炎多在在秋冬季发生,细菌性肠炎多在夏季,气温高、食物易发生变质的季节发生。病毒性肠炎临床表现为急性水样腹泻,中毒症状较轻,病程自限,而细菌性肠炎多以中毒症状为主,常伴里急后重感。实验室检查中,病毒性感染以淋巴细胞升高为主,细菌性感染则以白细胞及中性粒细胞为主。治疗上,病毒性肠炎是以抗病毒治疗为主,细菌性肠炎以抗生素治疗为主,两者都要保护肠道黏膜,纠正水电解质紊乱。