鼻咽癌在微观主要分为三类，角化性癌（keratinizing型），非角化性癌（non-keratinizing型）及未分化型。
家族因素
家族中若有人罹患鼻咽癌，则家族内其他人的罹病机率也增加，特别是一等亲的直系亲属。
生活及环境因素
经常食用腌渍或烟熏食物：鼻咽癌好发于华人和爱斯基摩人，罹病机率远高于欧美及日韩等民族，而中国东南沿海及台湾等地的居民罹病机率又高于中国北方，特别是广东地区，因此又有“广东癌”之称。即使是迁居海外的华侨，其罹病机率仍较当地人来得高。过去一般认为这和咸鱼的食用有密切联系，因为咸鱼含有致癌物亚硝胺。但这说法无法解释已移居海外且已无食用咸鱼习惯的移民及其后代仍有高罹病率， 且由外地移入广东而有食用咸鱼习惯者并无高罹病率， 因此现在普遍认为遗传基因为鼻咽癌主要的致病影响因子。[1]
抽烟
长期吸入刺激性物质，例如工业用的石绵、铬、镍等
工作场所不通风
EB病毒
研究显示鼻咽癌病人血清中的抗EB病毒抗体的种类及含量均高于一般人，而大部分中国南方的人均有EB病毒的接触史，虽然大部分人在一生中都不会发病，但有小部分人在接触特殊的外来环境，使体内的免疫系统与EB病毒产生特殊反应而发病。至于EB病毒导致鼻咽癌发病的基制仍待进一步研究。
其他
男性罹病机率高出女性三倍。
有鼻窦炎病史者罹病机率也较一般人高。