肛瘘是肛门瘘管的简称，是感染性管道，位于肛管直肠与肛门周围皮肤相通处。肛瘘是继痔疮之后肛门处最常见的疾病，该病发作时能使人疼痛难忍，对人体危害大。临床上可见，肛瘘的形成原因各种各样，包括根本原因和诱因。具体有以下几种原因：
一、肛周脓肿：是肛瘘形成的最主要原因，大部分肛瘘都是由肛门直肠脓肿破溃排脓后形成。肛瘘形成一般由四个阶段构成。第一个阶段：当粪便滞留肛隐时或者肛裂时可引起隐窝或者肛门瓣感染，易引起肛腺炎。如果没有得到及时治疗，炎症会变严重并向肛门周围蔓延。第二个阶段：炎症蔓延形成肛门直肠周围炎。这个时候如果炎症得到控制，病情可缓解，如果不能，则会侵入到抗病能力比较低的组织间隙之中。第三个阶段：病菌入侵、扩散、积聚到肛门直肠周围的组织间隙，形成肛门直肠周围脓肿。第四个阶段：肛门直肠周围的脓肿破溃或者得到处理后，形成瘘管，即肛瘘。
肛周脓肿有几个很主要的诱因：1、上厕所时玩手机，蹲了很长时间容易导致肛门直肠内发生淤血，一旦血运不畅就会导致细菌滋生，形成脓肿;2、腹泻或者便秘。大便干硬时肛管直肠易被损伤，使细菌侵入。腹泻时粪质稀薄，使肛窦极易被感染;3、烟酒和辛辣食品以及肥腻食物，吃下去后，在排便时对肛门瓣及肛窦有强烈的刺激作用，能够损伤肛门局部。
二、直肠肛门损伤：有时候不小心吞下去的鸡骨头、鱼刺或者不易消化的食物，经过消化道后容易侵入伤口引起肛周脓肿。
三、特殊菌感染：一些特殊的病菌会引发肛瘘，但这种情况比较少见。
肛瘘形成的原因还包括一些结核病、溃疡性大肠炎、克隆氏病、直肠肛管癌、血行感染等疾病引发的肛瘘。在对待此病时，患者应该保持良好的心态，治疗肛瘘的方法已经日益先进，只要好好配合医生，在饮食上，生活习惯上多多改善，该病是可以治愈的。
脓肿（25%）：
肛管直肠周围脓肿有2大类：一类与肛腺及肛瘘有关，称为原发性急性肛腺肌间瘘管性脓肿，简称瘘管性脓肿，较多见；一类与肛腺及肛瘘无关，称为急性非肛腺性非瘘管性脓肿，简称非瘘管性脓肿较少见；肛瘘大多由前者发展而来。肛瘘多为一般化脓性感染所致，少数为特异性感染，如结核，克罗恩病，溃疡性结肠炎。直肠肛管外伤继发感染也可形成肛瘘，直肠肛管恶性肿瘤也可溃破成瘘管，但都很少见，与一般化脓性肛瘘有明显区别。
性激素（30%）：
有人推测性激素的影响是肛瘘发生的主要原因，在青春期，人体自身的性激素开始活跃，随即一部分皮脂腺，特别是肛腺开始发育增殖，男性较女性增生明显，由于肛腺分泌旺盛，若加上肛腺排泄不畅或肛腺管阻滞，则易感染引起肛腺炎，这可解释男性青壮年为何肛瘘发病率较高，而女性肛腺导管较直，不如男性弯曲，分泌物不易淤积，所以女性肛瘘发病率较低，人到老年，与其他皮脂腺普遍萎缩的同时，肛腺也随之萎缩，故老年人肛瘘少见。
病原菌（15%）：
肛瘘有原发性内口，瘘管，支管和继发性外口，内口即感染源的入口，多在肛窦内及其附近，后正中线的两侧多见，但也可在直肠下部或肛管的任何部位，瘘管有直有弯，少数有分支，外口即脓肿溃破处或切开引流的部位，多位于肛管周围皮肤，由于病原菌不断经内口进入管道，加之管道迂曲行走于内，外括约肌附近，管壁由纤维组织构成，管内有肉芽组织，故经久不愈。
一般单纯性肛瘘只有1个内口和1个外口，这类肛瘘临床上最多见，若外口暂时封闭，局部引流不畅，则又逐渐发生感染，再次形成脓肿，封闭的外口可再穿破或在其他处形成另一外口，如此反复发作，使病变范围扩大或有时造成几个外口，与内口相通，这种肛瘘称为复杂性肛瘘，即有1个内口与多个外口，但有人认为，复杂性肛瘘不应以外口的多少划分，而是指主要瘘管累及肛管直肠环或环以上者，虽然这种肛瘘只有1个外口及1个内口，但治疗比较复杂，故称为复杂性肛瘘，相反，有时肛瘘虽有多个外口，但治疗并不复杂。
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