发育不良（45%）：
一般情况下睾丸发生扭转的本质原因是生殖器官的先天畸形，本病可能与解剖畸形或发育不全有关，如睾丸鞘膜囊过分宽大、精索过长或睾丸下降不全等。
外力作用（15%）：
外阴部的外伤、剧烈运动甚至天气寒冷使提睾肌痉挛或体位突然改变等亦可引起睾丸过度活动，有时外力不明显，甚至在睡眠中也可以发病，可能系睡眠中迷走神经兴奋、提睾肌随睾丸阴茎勃起而强烈收缩所致。诱发睾丸扭转。
隐睾（20%）：
隐睾为先天性阴囊内没有睾丸，它包括睾丸下降不全、睾丸异位和睾丸缺如。睾丸下降不全系指出生后睾丸未降至阴囊底部而停留在下降途中的某一部位，包括停留在腹腔内者。临床上常将睾丸下降不全称为隐睾。睾丸异位是睾丸离开正常下降途径、到达会阴部、股部、耻骨上、甚至对侧阴囊内。