一、西医治疗
药物治疗
沙眼衣原体对四环素族、大环内酯类及氟喹诺类抗菌药物敏感。
1、泌尿生殖系感染
可选用四环素或红霉素2g/d，分4次口服，疗程为2～3周。亦可用多西环素(doxycycline)0.4g/d，分2次口服，或阿奇霉素(azithromycin)、克林霉素(clindamycin)、克拉霉素(克拉红霉素)、氧氟沙星(ofloxacin)或利福平等药，上述药物疗效及副作用相近似，多西环素及四环素价格低而阿奇霉素较高。孕妇、哺乳期妇女及儿童不用四环素及氧氟沙星。
2.美国CDC推荐的治疗方案
治愈率达90%以上。
用四环素0.5g/次，1次/6h，或多西环素或米诺环素(minocycline)，0.1g/次，1次/12h，疗程7～10天。
用红霉素0.5g，1次/d，或阿莫西林或克林霉素0.5g/次，1次/8h，疗程7～10天。
头孢西丁2g加丙磺舒1g/次，或头孢曲松0.25g肌内注射加多西环素0.1g/次，2次/d，疗程10～14天。
①A方案：头孢西丁2g/次，1次/6h，静脉注射，多西环素0.1g/次，1 次/12h，临床症状改善后48h或出院后，继用多西环素0.1g，2次/d，疗程10～14天。
②B方案：克林霉素0.9g/次静脉注射，加庆大霉素3.5mg/kg体重，1次/8h，临床症状改善后48h或出院后，继用多西环素0.1g/次，2次/d，或克林霉素0.45g，5次/d，疗程10～14天。
多西环素0.1g，1 次/12h，或红霉素0.5g/次或磺胺甲噁唑(SMZ) 0.5g/次，1次/6h，疗程21天。
包涵体结膜炎用红霉素50mg/(kg·d)，分4次口服，疗程10～14天，肺炎亦用红霉素，疗程14～21天。
3.氟喹诺酮类药物治疗
氟喹诺酮类具有高效低毒特点可以使用，且又可同时治疗淋病。但孕妇、哺乳期妇女及儿童禁用，孕妇推荐用红霉素治疗，如不能耐受可用阿莫西林。国外临床试验证实，对比阿奇霉素和阿莫西林治疗孕妇的沙眼衣原体感染的疗效和耐受性，结果两者疗效均好，对阿莫西林的耐受性优于阿奇霉素。
由于本病易合并淋球菌及厌氧菌感染，须兼顾治疗。且由于本病原体繁殖周期长，抗菌治疗时细菌可被暂时抑制，故应在抗菌治疗结束后3～4周再进行病原体培养，以判断其是否被清除。
4.沙眼及包涵体结膜炎
局部可滴用0.1%利福平或15%磺胺醋酰钠滴眼液，晚上用四环素或红霉素软膏。
手术治疗
用于眼部并发症如严重的内翻倒睫，性病性淋巴肉芽肿引起的化脓性淋巴结炎、象皮肿、严重的直肠狭窄或尿道狭窄及某些女性不孕的合并症等。
沙眼辨证论治
二、沙眼中医治疗
中药方剂
【辨证】湿热壅盛。
【治法】散风清脾，祛湿。
【方名】除风清脾饮。
【组成】陈皮10克，连翘10克，防风8克，知母10克，玄明粉(冲服)12克，黄芩10克，玄参10克，黄连10克，荆芥6克，大黄10克，桔梗10克，生地黄10克。
【用法】水煎服，每日1剂，日服2次
沙眼