发生易性症的原因至今不明，目前的解释都是一些猜想、假说，并没有确凿的研究证据支持。
1. 从生物学角度的猜想认为： 母亲怀孕时体内激素紊乱，导致男胎雌化/女胎雄化；或易性症人群的丘脑「自我识别中心」发生了病变；或易性症人群的染色体存在异常。
2. 从心理学角度的猜想包括：
（1）精神分析流派认为，俄狄浦斯阶段（恋母情结期）个体没有解决的分离焦虑导致了易性症的发生。
（2）行为主义流派认为，父母在教养过程中对孩子表现出的交叉性别行为不加阻止、甚至明确鼓励，导致孩子对后天习得性别的认知和其生理性别产生了冲突。
（3）社会建构主义认为，人没有天生的性别认同，是在成长过程中经过社会建构后，才成长为男人和女人。如果儿童到了一定年龄还不能从心理上认同自己的性别，而是一味模仿异性，达到一定程度后就会形成性别认同障碍。
易性症