一般治疗方法
食管癌的治疗方法取决于癌细胞的类型（腺癌（adenocarcinoma）/鳞癌（squamous cell carcinoma）或其他形态）、肿瘤分期、患者一般情况和有无其他疾病而定。总的来说，患者需要保证摄入足够的营养和得到适当的口腔卫生护理。
对于不能吞咽的患者，可以考虑在食道内插入人工支架（stent）以缓解其进食、饮水、吞咽唾液的困难。人工支架也可以用于缓解封闭瘘的症状。不能正常进食或在治疗期间的患者可使用安置胃管或胃造瘘术（人工造成通过皮肤直接进胃的孔道）。有些患者容易将食物或唾液后吸入气管，导致吸入性肺炎，这些人也可受益于胃管或胃造瘘。
肿瘤治疗
约20-30%的患者病灶限于局部，可以考虑外科手术治疗。体积较大但仍属局部的肿瘤可以先施以化学疗法或放射疗法，把肿瘤缩小到适宜手术的范围（不过这类疗法目前在医学界还很有争议）。
目的为治愈的手术主要是食管切除术--人为切除包含病灶的部分或全部食道。分经裂孔（从颈和腹部同时进入）、开胸和三切口（经右胸、颈、腹）三种是。因为切除后食道缩短，一般将胃上提并与食道断段吻合，或截取部分肠替代食道。对于已经扩散的肿瘤，以治愈为目的的切除已没有意义，但仍可以考虑为了缓解患者症状的外科手术。
激光疗法使用高强度的光来消灭肿瘤细胞，而不伤害身体其他部位。此疗法一般用于手术无法切除的肿瘤，以减轻梗阻和疼痛、促进吞咽。光动力疗法（PDT）是一种特殊的激光疗法。患者摄入特殊的药物，经特殊光源照射，活化在肿瘤细胞中聚集的药物成分，从而杀灭癌细胞。
食管癌的化学疗法由肿瘤分型而各异。常用的化疗药物是每三周给予顺铂（顺一双氨双氯铂，cisplatin）、卡铂（顺二氨环丁烷铂，carboplatin）或奥沙利铂（双胺类环己烷草酸铂，oxaliplatin），同时持续或每三周给予5-氟尿嘧啶（5-FU）。更新的研究结果发现，对晚期不易手术的患者，加上泛艾霉素（Epirubicin, ECF）的效果更好化疗可以作为术后巩固治疗（用来降低复发的可能）、术前巩固治疗；而对于不宜手术的情况也可用顺铂和5-氟尿嘧啶化疗。目前的临床试验着重于比较不同化疗药物组合的效果。例如已在II/III期的REAL-2试验比较了四个不同组合--泛艾霉素10公丝和顺铂或奥沙利铂，同时不断注入氟尿嘧啶或卡培他滨（氟嘧啶氨基硝酸盐，capecitabine）。
放射线疗法可以在化疗或手术前/后/中进行，有的时候单用来对症治疗。对于病灶未转移，但因其他原因不宜手术的患者，化疗也可作为治愈手段。